Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK7P50613 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK7P50613 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK7P50613 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK7P50613 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDK7P50613 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK7P50613 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK7P50613 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK7P50613 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK7P50613 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK7P50613 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK7P50613 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK7P50613 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK7P50613 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK7P50613 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK7P50613 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK7P50613 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK7P50613 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK7P50613 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK7P50613 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK7P50613 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK7P50613 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK7P50613 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK7P50613 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK7P50613 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK7P50613 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK7P50613 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK7P50613 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK7P50613 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK7P50613 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK7P50613 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK7P50613 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK7P50613 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK7P50613 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK7P50613 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK7P50613 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK7P50613 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK7P50613 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK7P50613 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK7P50613 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK7P50613 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK7P50613 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK7P50613 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK7P50613 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK7P50613 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK7P50613 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK7P50613 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK7P50613 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK7P50613 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK7P50613 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK7P50613 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK7P50613 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK7P50613 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK7P50613 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK7P50613 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK7P50613 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK7P50613 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK7P50613 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK7P50613 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK7P50613 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK7P50613 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK7P50613 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK7P50613 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK7P50613 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK7P50613 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK7P50613 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK7P50613 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK7P50613 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK7P50613 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK7P50613 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK7P50613 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK7P50613 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK7P50613 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK7P50613 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK7P50613 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK7P50613 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK7P50613 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK7P50613 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK7P50613 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK7P50613 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK7P50613 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK7P50613 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK7P50613 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK7P50613 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK7P50613 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK7P50613 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK7P50613 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK7P50613 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK7P50613 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK7P50613 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK7P50613 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK7P50613 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK7P50613 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK7P50613 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK7P50613 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK7P50613 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK7P50613 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK7P50613 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK7P50613 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDK7P50613 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 480.2 ms