Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSEN2P49810 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSEN2P49810 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSEN2P49810 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms