Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HARS2P49590 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HARS2P49590 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HARS2P49590 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HARS2P49590 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HARS2P49590 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HARS2P49590 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARS2P49590 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARS2P49590 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HARS2P49590 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARS2P49590 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HARS2P49590 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HARS2P49590 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HARS2P49590 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HARS2P49590 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HARS2P49590 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HARS2P49590 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARS2P49590 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARS2P49590 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARS2P49590 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARS2P49590 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARS2P49590 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARS2P49590 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARS2P49590 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARS2P49590 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HARS2P49590 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARS2P49590 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARS2P49590 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARS2P49590 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARS2P49590 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARS2P49590 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARS2P49590 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARS2P49590 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARS2P49590 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARS2P49590 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARS2P49590 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARS2P49590 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARS2P49590 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HARS2P49590 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARS2P49590 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARS2P49590 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARS2P49590 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARS2P49590 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARS2P49590 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARS2P49590 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HARS2P49590 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARS2P49590 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARS2P49590 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARS2P49590 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HARS2P49590 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARS2P49590 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARS2P49590 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARS2P49590 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARS2P49590 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HARS2P49590 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARS2P49590 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARS2P49590 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HARS2P49590 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARS2P49590 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HARS2P49590 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARS2P49590 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARS2P49590 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARS2P49590 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HARS2P49590 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARS2P49590 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARS2P49590 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARS2P49590 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARS2P49590 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARS2P49590 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARS2P49590 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARS2P49590 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HARS2P49590 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARS2P49590 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARS2P49590 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HARS2P49590 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARS2P49590 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARS2P49590 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARS2P49590 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARS2P49590 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HARS2P49590 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HARS2P49590 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARS2P49590 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HARS2P49590 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARS2P49590 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARS2P49590 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARS2P49590 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARS2P49590 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARS2P49590 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARS2P49590 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARS2P49590 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HARS2P49590 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARS2P49590 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARS2P49590 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARS2P49590 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARS2P49590 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HARS2P49590 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARS2P49590 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARS2P49590 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARS2P49590 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HARS2P49590 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms