Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPFP49454 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPFP49454 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPFP49454 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPFP49454 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPFP49454 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPFP49454 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPFP49454 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPFP49454 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPFP49454 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPFP49454 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPFP49454 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPFP49454 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPFP49454 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPFP49454 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPFP49454 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPFP49454 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPFP49454 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPFP49454 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPFP49454 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPFP49454 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPFP49454 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPFP49454 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPFP49454 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CENPFP49454 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CENPFP49454 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CENPFP49454 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CENPFP49454 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPFP49454 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPFP49454 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPFP49454 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPFP49454 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPFP49454 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPFP49454 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPFP49454 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPFP49454 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPFP49454 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPFP49454 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPFP49454 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPFP49454 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPFP49454 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPFP49454 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPFP49454 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPFP49454 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPFP49454 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPFP49454 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPFP49454 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPFP49454 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPFP49454 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPFP49454 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPFP49454 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPFP49454 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPFP49454 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPFP49454 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPFP49454 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPFP49454 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPFP49454 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPFP49454 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPFP49454 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPFP49454 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPFP49454 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPFP49454 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPFP49454 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPFP49454 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPFP49454 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPFP49454 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPFP49454 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPFP49454 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPFP49454 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPFP49454 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPFP49454 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPFP49454 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPFP49454 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPFP49454 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPFP49454 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPFP49454 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPFP49454 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPFP49454 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPFP49454 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPFP49454 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPFP49454 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPFP49454 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPFP49454 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPFP49454 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPFP49454 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPFP49454 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPFP49454 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPFP49454 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPFP49454 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPFP49454 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPFP49454 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPFP49454 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPFP49454 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPFP49454 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPFP49454 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPFP49454 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPFP49454 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPFP49454 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPFP49454 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPFP49454 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms