Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMAN1P49257 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMAN1P49257 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMAN1P49257 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.1 ms