Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSNK1DP48730 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK1DP48730 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms