Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL21P46778 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL21P46778 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL21P46778 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL21P46778 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL21P46778 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL21P46778 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL21P46778 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL21P46778 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL21P46778 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL21P46778 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL21P46778 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL21P46778 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPL21P46778 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL21P46778 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL21P46778 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL21P46778 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL21P46778 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL21P46778 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL21P46778 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL21P46778 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPL21P46778 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPL21P46778 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL21P46778 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL21P46778 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL21P46778 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPL21P46778 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL21P46778 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL21P46778 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL21P46778 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL21P46778 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL21P46778 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL21P46778 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL21P46778 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL21P46778 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL21P46778 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL21P46778 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL21P46778 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL21P46778 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL21P46778 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL21P46778 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL21P46778 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL21P46778 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL21P46778 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL21P46778 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL21P46778 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL21P46778 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPL21P46778 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL21P46778 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL21P46778 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL21P46778 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL21P46778 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL21P46778 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL21P46778 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL21P46778 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL21P46778 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL21P46778 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL21P46778 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL21P46778 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL21P46778 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL21P46778 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL21P46778 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL21P46778 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL21P46778 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPL21P46778 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL21P46778 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL21P46778 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL21P46778 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL21P46778 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL21P46778 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL21P46778 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL21P46778 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL21P46778 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL21P46778 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL21P46778 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL21P46778 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL21P46778 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL21P46778 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL21P46778 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL21P46778 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL21P46778 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL21P46778 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL21P46778 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL21P46778 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL21P46778 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL21P46778 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL21P46778 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL21P46778 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL21P46778 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL21P46778 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL21P46778 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL21P46778 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL21P46778 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL21P46778 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL21P46778 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL21P46778 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL21P46778 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL21P46778 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL21P46778 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL21P46778 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms