Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNA4P43681 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA4P43681 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNA4P43681 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms