Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAGEA3P43357 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAGEA3P43357 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAGEA3P43357 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms