Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MAGEA1P43355 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MAGEA1P43355 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms