Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSR1P43307 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSR1P43307 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSR1P43307 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SSR1P43307 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSR1P43307 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSR1P43307 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSR1P43307 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSR1P43307 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSR1P43307 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSR1P43307 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSR1P43307 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SSR1P43307 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSR1P43307 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSR1P43307 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SSR1P43307 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSR1P43307 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSR1P43307 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSR1P43307 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSR1P43307 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSR1P43307 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSR1P43307 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SSR1P43307 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SSR1P43307 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSR1P43307 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SSR1P43307 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSR1P43307 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSR1P43307 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSR1P43307 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSR1P43307 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSR1P43307 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSR1P43307 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSR1P43307 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSR1P43307 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSR1P43307 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSR1P43307 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSR1P43307 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSR1P43307 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSR1P43307 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SSR1P43307 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSR1P43307 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSR1P43307 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSR1P43307 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSR1P43307 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSR1P43307 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSR1P43307 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSR1P43307 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSR1P43307 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSR1P43307 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSR1P43307 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSR1P43307 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSR1P43307 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSR1P43307 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SSR1P43307 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSR1P43307 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSR1P43307 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSR1P43307 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SSR1P43307 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSR1P43307 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSR1P43307 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSR1P43307 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSR1P43307 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SSR1P43307 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSR1P43307 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSR1P43307 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSR1P43307 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSR1P43307 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSR1P43307 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR1P43307 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR1P43307 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR1P43307 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR1P43307 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR1P43307 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR1P43307 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR1P43307 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR1P43307 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR1P43307 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR1P43307 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR1P43307 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSR1P43307 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR1P43307 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR1P43307 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR1P43307 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR1P43307 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR1P43307 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR1P43307 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR1P43307 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR1P43307 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR1P43307 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR1P43307 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSR1P43307 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR1P43307 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR1P43307 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR1P43307 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR1P43307 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR1P43307 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR1P43307 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR1P43307 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR1P43307 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR1P43307 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms