Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC1A4P43007 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC1A4P43007 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC1A4P43007 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms