Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC1P41238 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC1P41238 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC1P41238 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC1P41238 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC1P41238 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC1P41238 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOBEC1P41238 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms