Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
THPOP40225 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
THPOP40225 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THPOP40225 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THPOP40225 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THPOP40225 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THPOP40225 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THPOP40225 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THPOP40225 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THPOP40225 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THPOP40225 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THPOP40225 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THPOP40225 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THPOP40225 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THPOP40225 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THPOP40225 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THPOP40225 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THPOP40225 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THPOP40225 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THPOP40225 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THPOP40225 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
THPOP40225 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THPOP40225 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THPOP40225 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THPOP40225 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THPOP40225 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THPOP40225 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THPOP40225 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
THPOP40225 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THPOP40225 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THPOP40225 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THPOP40225 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
THPOP40225 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
THPOP40225 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THPOP40225 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THPOP40225 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THPOP40225 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
THPOP40225 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THPOP40225 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THPOP40225 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THPOP40225 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THPOP40225 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
THPOP40225 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THPOP40225 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THPOP40225 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THPOP40225 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THPOP40225 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THPOP40225 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THPOP40225 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THPOP40225 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
THPOP40225 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THPOP40225 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THPOP40225 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
THPOP40225 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THPOP40225 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THPOP40225 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THPOP40225 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THPOP40225 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THPOP40225 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THPOP40225 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THPOP40225 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THPOP40225 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THPOP40225 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THPOP40225 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
THPOP40225 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THPOP40225 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THPOP40225 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
THPOP40225 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THPOP40225 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THPOP40225 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THPOP40225 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
THPOP40225 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
THPOP40225 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THPOP40225 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THPOP40225 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THPOP40225 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THPOP40225 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THPOP40225 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THPOP40225 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THPOP40225 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
THPOP40225 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THPOP40225 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THPOP40225 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THPOP40225 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THPOP40225 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THPOP40225 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THPOP40225 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THPOP40225 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THPOP40225 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THPOP40225 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THPOP40225 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THPOP40225 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
THPOP40225 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THPOP40225 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THPOP40225 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THPOP40225 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THPOP40225 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THPOP40225 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
THPOP40225 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THPOP40225 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms