Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCNN1AP37088 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1AP37088 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1AP37088 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms