Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJC1P36383 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJC1P36383 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJC1P36383 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJC1P36383 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJC1P36383 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJC1P36383 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJC1P36383 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJC1P36383 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GJC1P36383 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJC1P36383 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GJC1P36383 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJC1P36383 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJC1P36383 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GJC1P36383 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJC1P36383 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJC1P36383 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJC1P36383 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJC1P36383 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJC1P36383 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJC1P36383 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJC1P36383 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GJC1P36383 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJC1P36383 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GJC1P36383 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJC1P36383 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJC1P36383 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GJC1P36383 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJC1P36383 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJC1P36383 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJC1P36383 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJC1P36383 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GJC1P36383 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJC1P36383 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJC1P36383 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJC1P36383 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJC1P36383 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJC1P36383 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJC1P36383 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GJC1P36383 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC1P36383 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC1P36383 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC1P36383 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC1P36383 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC1P36383 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC1P36383 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC1P36383 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC1P36383 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC1P36383 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC1P36383 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC1P36383 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC1P36383 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GJC1P36383 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJC1P36383 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJC1P36383 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GJC1P36383 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJC1P36383 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJC1P36383 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJC1P36383 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC1P36383 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC1P36383 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC1P36383 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC1P36383 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC1P36383 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC1P36383 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC1P36383 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC1P36383 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC1P36383 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC1P36383 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJC1P36383 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJC1P36383 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJC1P36383 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJC1P36383 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJC1P36383 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJC1P36383 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GJC1P36383 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJC1P36383 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJC1P36383 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJC1P36383 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJC1P36383 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJC1P36383 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJC1P36383 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJC1P36383 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJC1P36383 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJC1P36383 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJC1P36383 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJC1P36383 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJC1P36383 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJC1P36383 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJC1P36383 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJC1P36383 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJC1P36383 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJC1P36383 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJC1P36383 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJC1P36383 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJC1P36383 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJC1P36383 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJC1P36383 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJC1P36383 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJC1P36383 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms