Protein–RNA interactions for Protein: P36000

APL2, AP-1 complex subunit beta-1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL2P36000 CDS1YBR029C 1374 nt6.78□□□□□ -1.32
APL2P36000 HSP78YDR258C 2436 nt6.77□□□□□ -1.33
APL2P36000 YEL074WYEL074W 339 nt6.77□□□□□ -1.33
APL2P36000 PRO3YER023W 861 nt6.77□□□□□ -1.33
APL2P36000 JJJ3YJR097W 519 nt6.77□□□□□ -1.33
APL2P36000 MRPL24YMR193W 777 nt6.77□□□□□ -1.33
APL2P36000 YOR318CYOR318C 306 nt6.77□□□□□ -1.33
APL2P36000 VNX1YNL321W 2727 nt6.77□□□□□ -1.33
APL2P36000 GLN3YER040W 2193 nt6.76□□□□□ -1.33
APL2P36000 snR78snR78 87 nt6.76□□□□□ -1.33
APL2P36000 SLO1YER180C-A 258 nt6.76□□□□□ -1.33
APL2P36000 MRS1YIR021W 1092 nt6.76□□□□□ -1.33
APL2P36000 SIT1YEL065W 1887 nt6.75□□□□□ -1.33
APL2P36000 URE2YNL229C 1065 nt6.75□□□□□ -1.33
APL2P36000 DSE3YOR264W 1293 nt6.75□□□□□ -1.33
APL2P36000 VMA4YOR332W 702 nt6.75□□□□□ -1.33
APL2P36000 CLN1YMR199W 1641 nt6.75□□□□□ -1.33
APL2P36000 CYC8YBR112C 2901 nt6.75□□□□□ -1.33
APL2P36000 CDC10YCR002C 969 nt6.74□□□□□ -1.33
APL2P36000 SFC1YJR095W 969 nt6.74□□□□□ -1.33
APL2P36000 SEC18YBR080C 2277 nt6.74□□□□□ -1.33
APL2P36000 YNL247WYNL247W 2304 nt6.73□□□□□ -1.33
APL2P36000 ASN1YPR145W 1719 nt6.73□□□□□ -1.33
APL2P36000 AIM17YHL021C 1398 nt6.73□□□□□ -1.33
APL2P36000 HXT2YMR011W 1626 nt6.73□□□□□ -1.33
APL2P36000 MMP1YLL061W 1752 nt6.73□□□□□ -1.33
APL2P36000 YJR015WYJR015W 1533 nt6.73□□□□□ -1.33
APL2P36000 YGL072CYGL072C 360 nt6.73□□□□□ -1.33
APL2P36000 YLL059CYLL059C 507 nt6.73□□□□□ -1.33
APL2P36000 CTR1YPR124W 1221 nt6.73□□□□□ -1.33
APL2P36000 DPB2YPR175W 2070 nt6.73□□□□□ -1.33
APL2P36000 NOG2YNR053C 1461 nt6.73□□□□□ -1.33
APL2P36000 TRP1YDR007W 675 nt6.72□□□□□ -1.33
APL2P36000 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt6.72□□□□□ -1.33
APL2P36000 RPN7YPR108W 1290 nt6.72□□□□□ -1.33
APL2P36000 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.72□□□□□ -1.33
APL2P36000 IMA2YOL157C 1770 nt6.72□□□□□ -1.33
APL2P36000 DDC1YPL194W 1839 nt6.71□□□□□ -1.33
APL2P36000 YOL079WYOL079W 399 nt6.71□□□□□ -1.34
APL2P36000 SAM4YPL273W 978 nt6.71□□□□□ -1.34
APL2P36000 ARO10YDR380W 1908 nt6.71□□□□□ -1.34
APL2P36000 HXK2YGL253W 1461 nt6.71□□□□□ -1.34
APL2P36000 TRK2YKR050W 2670 nt6.7□□□□□ -1.34
APL2P36000 MHR1YDR296W 681 nt6.7□□□□□ -1.34
APL2P36000 YHR127WYHR127W 732 nt6.7□□□□□ -1.34
APL2P36000 YNL019CYNL019C 855 nt6.7□□□□□ -1.34
APL2P36000 YNL033WYNL033W 855 nt6.7□□□□□ -1.34
APL2P36000 YNL234WYNL234W 1281 nt6.7□□□□□ -1.34
APL2P36000 SMF2YHR050W 1650 nt6.7□□□□□ -1.34
APL2P36000 VMS1YDR049W 1899 nt6.7□□□□□ -1.34
APL2P36000 UGO1YDR470C 1509 nt6.7□□□□□ -1.34
APL2P36000 STL1YDR536W 1710 nt6.7□□□□□ -1.34
APL2P36000 SOG2YOR353C 2376 nt6.69□□□□□ -1.34
APL2P36000 SOH1YGL127C 384 nt6.69□□□□□ -1.34
APL2P36000 TDH3YGR192C 999 nt6.69□□□□□ -1.34
APL2P36000 RPT1YKL145W 1404 nt6.68□□□□□ -1.34
APL2P36000 POP1YNL221C 2628 nt6.68□□□□□ -1.34
APL2P36000 GET3YDL100C 1065 nt6.68□□□□□ -1.34
APL2P36000 GFD1YMR255W 567 nt6.68□□□□□ -1.34
APL2P36000 BBP1YPL255W 1158 nt6.68□□□□□ -1.34
APL2P36000 HIR1YBL008W 2523 nt6.68□□□□□ -1.34
APL2P36000 NDC1YML031W 1968 nt6.68□□□□□ -1.34
APL2P36000 YEH1YLL012W 1722 nt6.67□□□□□ -1.34
APL2P36000 BPL1YDL141W 2073 nt6.67□□□□□ -1.34
APL2P36000 RAI1YGL246C 1164 nt6.67□□□□□ -1.34
APL2P36000 RSA3YLR221C 663 nt6.67□□□□□ -1.34
APL2P36000 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt6.67□□□□□ -1.34
APL2P36000 CBC2YPL178W 627 nt6.67□□□□□ -1.34
APL2P36000 RBD2YPL246C 789 nt6.67□□□□□ -1.34
APL2P36000 YHR045WYHR045W 1683 nt6.66□□□□□ -1.34
APL2P36000 LSM12YHR121W 564 nt6.66□□□□□ -1.34
APL2P36000 CIS3YJL158C 684 nt6.66□□□□□ -1.34
APL2P36000 YJU2YKL095W 837 nt6.66□□□□□ -1.34
APL2P36000 ETR1YBR026C 1143 nt6.66□□□□□ -1.34
APL2P36000 ISC1YER019W 1434 nt6.66□□□□□ -1.34
APL2P36000 QDR3YBR043C 2070 nt6.65□□□□□ -1.34
APL2P36000 YBR138CYBR138C 1575 nt6.65□□□□□ -1.34
APL2P36000 PHO8YDR481C 1701 nt6.65□□□□□ -1.34
APL2P36000 IMA5YJL216C 1746 nt6.65□□□□□ -1.34
APL2P36000 RRP45YDR280W 918 nt6.65□□□□□ -1.34
APL2P36000 FPR2YDR519W 408 nt6.65□□□□□ -1.34
APL2P36000 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt6.65□□□□□ -1.34
APL2P36000 NDJ1YOL104C 1059 nt6.65□□□□□ -1.34
APL2P36000 VPS4YPR173C 1314 nt6.65□□□□□ -1.35
APL2P36000 YGL036WYGL036W 2730 nt6.65□□□□□ -1.35
APL2P36000 SVF1YDR346C 1446 nt6.65□□□□□ -1.35
APL2P36000 ALT1YLR089C 1779 nt6.64□□□□□ -1.35
APL2P36000 TRP5YGL026C 2124 nt6.64□□□□□ -1.35
APL2P36000 SNZ3YFL059W 897 nt6.64□□□□□ -1.35
APL2P36000 ATP14YLR295C 375 nt6.64□□□□□ -1.35
APL2P36000 SNZ2YNL333W 897 nt6.64□□□□□ -1.35
APL2P36000 TOS4YLR183C 1470 nt6.64□□□□□ -1.35
APL2P36000 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt6.63□□□□□ -1.35
APL2P36000 RPS15YOL040C 429 nt6.63□□□□□ -1.35
APL2P36000 EFT2YDR385W 2529 nt6.62□□□□□ -1.35
APL2P36000 EFT1YOR133W 2529 nt6.62□□□□□ -1.35
APL2P36000 NOP7YGR103W 1818 nt6.62□□□□□ -1.35
APL2P36000 LDB19YOR322C 2457 nt6.61□□□□□ -1.35
APL2P36000 DIT1YDR403W 1611 nt6.61□□□□□ -1.35
APL2P36000 APM4YOL062C 1476 nt6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.9 ms