Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RFC4P35249 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RFC4P35249 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RFC4P35249 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RFC4P35249 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RFC4P35249 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RFC4P35249 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RFC4P35249 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RFC4P35249 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RFC4P35249 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RFC4P35249 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RFC4P35249 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RFC4P35249 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RFC4P35249 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RFC4P35249 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RFC4P35249 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RFC4P35249 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RFC4P35249 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RFC4P35249 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RFC4P35249 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RFC4P35249 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RFC4P35249 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RFC4P35249 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RFC4P35249 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RFC4P35249 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RFC4P35249 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RFC4P35249 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RFC4P35249 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RFC4P35249 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RFC4P35249 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RFC4P35249 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RFC4P35249 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RFC4P35249 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RFC4P35249 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RFC4P35249 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RFC4P35249 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RFC4P35249 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RFC4P35249 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RFC4P35249 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RFC4P35249 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RFC4P35249 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RFC4P35249 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RFC4P35249 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RFC4P35249 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
RFC4P35249 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RFC4P35249 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RFC4P35249 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RFC4P35249 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RFC4P35249 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RFC4P35249 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RFC4P35249 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RFC4P35249 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RFC4P35249 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RFC4P35249 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RFC4P35249 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RFC4P35249 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RFC4P35249 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RFC4P35249 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RFC4P35249 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RFC4P35249 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RFC4P35249 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RFC4P35249 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RFC4P35249 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RFC4P35249 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RFC4P35249 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RFC4P35249 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RFC4P35249 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RFC4P35249 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RFC4P35249 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RFC4P35249 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RFC4P35249 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RFC4P35249 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RFC4P35249 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RFC4P35249 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RFC4P35249 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RFC4P35249 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RFC4P35249 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RFC4P35249 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RFC4P35249 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RFC4P35249 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RFC4P35249 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RFC4P35249 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RFC4P35249 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RFC4P35249 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RFC4P35249 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RFC4P35249 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RFC4P35249 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RFC4P35249 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RFC4P35249 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RFC4P35249 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RFC4P35249 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RFC4P35249 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RFC4P35249 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RFC4P35249 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RFC4P35249 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RFC4P35249 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RFC4P35249 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RFC4P35249 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RFC4P35249 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RFC4P35249 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms