Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFTPDP35247 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms