Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCVRNP35243 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCVRNP35243 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCVRNP35243 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RCVRNP35243 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCVRNP35243 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCVRNP35243 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCVRNP35243 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RCVRNP35243 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RCVRNP35243 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCVRNP35243 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms