Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CPS1P31327 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CPS1P31327 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CPS1P31327 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CPS1P31327 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CPS1P31327 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CPS1P31327 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CPS1P31327 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CPS1P31327 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CPS1P31327 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CPS1P31327 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CPS1P31327 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CPS1P31327 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CPS1P31327 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CPS1P31327 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CPS1P31327 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CPS1P31327 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CPS1P31327 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CPS1P31327 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CPS1P31327 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CPS1P31327 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CPS1P31327 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CPS1P31327 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CPS1P31327 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CPS1P31327 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CPS1P31327 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CPS1P31327 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CPS1P31327 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CPS1P31327 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CPS1P31327 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CPS1P31327 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CPS1P31327 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CPS1P31327 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CPS1P31327 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CPS1P31327 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CPS1P31327 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CPS1P31327 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CPS1P31327 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CPS1P31327 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CPS1P31327 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CPS1P31327 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CPS1P31327 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CPS1P31327 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CPS1P31327 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CPS1P31327 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CPS1P31327 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CPS1P31327 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CPS1P31327 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CPS1P31327 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CPS1P31327 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CPS1P31327 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CPS1P31327 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CPS1P31327 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CPS1P31327 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CPS1P31327 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CPS1P31327 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CPS1P31327 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CPS1P31327 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CPS1P31327 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CPS1P31327 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CPS1P31327 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CPS1P31327 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CPS1P31327 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CPS1P31327 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CPS1P31327 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CPS1P31327 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CPS1P31327 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CPS1P31327 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CPS1P31327 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CPS1P31327 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CPS1P31327 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CPS1P31327 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CPS1P31327 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CPS1P31327 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CPS1P31327 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CPS1P31327 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CPS1P31327 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CPS1P31327 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CPS1P31327 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CPS1P31327 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CPS1P31327 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CPS1P31327 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CPS1P31327 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CPS1P31327 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CPS1P31327 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CPS1P31327 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CPS1P31327 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CPS1P31327 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CPS1P31327 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CPS1P31327 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CPS1P31327 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CPS1P31327 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CPS1P31327 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CPS1P31327 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CPS1P31327 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CPS1P31327 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CPS1P31327 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CPS1P31327 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CPS1P31327 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CPS1P31327 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms