Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC8P31273 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXC8P31273 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC8P31273 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms