Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-FP30511 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-FP30511 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-FP30511 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms