Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIPP30301 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIPP30301 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIPP30301 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIPP30301 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIPP30301 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIPP30301 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIPP30301 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIPP30301 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIPP30301 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIPP30301 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIPP30301 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIPP30301 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIPP30301 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIPP30301 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIPP30301 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIPP30301 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIPP30301 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIPP30301 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIPP30301 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIPP30301 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPP30301 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPP30301 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPP30301 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPP30301 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPP30301 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MIPP30301 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIPP30301 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIPP30301 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIPP30301 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIPP30301 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIPP30301 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIPP30301 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIPP30301 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIPP30301 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIPP30301 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIPP30301 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIPP30301 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIPP30301 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIPP30301 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIPP30301 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIPP30301 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIPP30301 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIPP30301 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIPP30301 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIPP30301 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MIPP30301 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIPP30301 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIPP30301 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIPP30301 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIPP30301 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIPP30301 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIPP30301 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIPP30301 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIPP30301 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIPP30301 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIPP30301 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIPP30301 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIPP30301 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIPP30301 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIPP30301 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIPP30301 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIPP30301 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIPP30301 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIPP30301 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIPP30301 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIPP30301 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIPP30301 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIPP30301 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIPP30301 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIPP30301 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIPP30301 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIPP30301 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIPP30301 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MIPP30301 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIPP30301 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIPP30301 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIPP30301 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIPP30301 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIPP30301 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MIPP30301 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIPP30301 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIPP30301 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIPP30301 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIPP30301 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIPP30301 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIPP30301 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MIPP30301 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIPP30301 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIPP30301 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIPP30301 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIPP30301 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIPP30301 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIPP30301 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIPP30301 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MIPP30301 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIPP30301 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIPP30301 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MIPP30301 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIPP30301 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms