Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5F1P24539 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATP5F1P24539 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.6 ms