Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND1P24385 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND1P24385 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND1P24385 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND1P24385 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND1P24385 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND1P24385 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND1P24385 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND1P24385 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND1P24385 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND1P24385 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND1P24385 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND1P24385 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND1P24385 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND1P24385 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND1P24385 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND1P24385 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCND1P24385 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCND1P24385 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCND1P24385 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCND1P24385 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND1P24385 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND1P24385 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND1P24385 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND1P24385 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND1P24385 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND1P24385 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND1P24385 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCND1P24385 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCND1P24385 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCND1P24385 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCND1P24385 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCND1P24385 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCND1P24385 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND1P24385 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND1P24385 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND1P24385 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND1P24385 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCND1P24385 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND1P24385 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND1P24385 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND1P24385 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND1P24385 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND1P24385 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND1P24385 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND1P24385 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCND1P24385 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND1P24385 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND1P24385 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND1P24385 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND1P24385 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND1P24385 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND1P24385 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND1P24385 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND1P24385 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCND1P24385 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND1P24385 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND1P24385 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND1P24385 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND1P24385 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND1P24385 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCND1P24385 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND1P24385 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND1P24385 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND1P24385 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND1P24385 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND1P24385 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND1P24385 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND1P24385 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND1P24385 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND1P24385 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCND1P24385 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND1P24385 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND1P24385 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND1P24385 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCND1P24385 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND1P24385 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND1P24385 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND1P24385 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND1P24385 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND1P24385 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND1P24385 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND1P24385 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND1P24385 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND1P24385 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND1P24385 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND1P24385 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND1P24385 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND1P24385 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND1P24385 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND1P24385 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND1P24385 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND1P24385 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND1P24385 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND1P24385 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND1P24385 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND1P24385 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND1P24385 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND1P24385 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND1P24385 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms