Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAX3P23760 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAX3P23760 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAX3P23760 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAX3P23760 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAX3P23760 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAX3P23760 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PAX3P23760 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAX3P23760 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAX3P23760 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAX3P23760 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAX3P23760 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAX3P23760 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAX3P23760 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAX3P23760 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAX3P23760 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAX3P23760 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAX3P23760 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PAX3P23760 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAX3P23760 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PAX3P23760 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PAX3P23760 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAX3P23760 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAX3P23760 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PAX3P23760 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAX3P23760 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAX3P23760 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PAX3P23760 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAX3P23760 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAX3P23760 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX3P23760 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX3P23760 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX3P23760 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX3P23760 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX3P23760 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX3P23760 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX3P23760 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAX3P23760 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAX3P23760 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAX3P23760 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAX3P23760 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAX3P23760 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAX3P23760 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAX3P23760 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAX3P23760 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAX3P23760 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAX3P23760 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAX3P23760 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAX3P23760 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PAX3P23760 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAX3P23760 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAX3P23760 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAX3P23760 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PAX3P23760 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAX3P23760 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAX3P23760 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAX3P23760 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PAX3P23760 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAX3P23760 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAX3P23760 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAX3P23760 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAX3P23760 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAX3P23760 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAX3P23760 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAX3P23760 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PAX3P23760 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PAX3P23760 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAX3P23760 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PAX3P23760 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAX3P23760 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAX3P23760 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAX3P23760 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAX3P23760 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAX3P23760 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAX3P23760 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAX3P23760 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAX3P23760 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAX3P23760 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAX3P23760 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAX3P23760 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAX3P23760 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAX3P23760 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PAX3P23760 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX3P23760 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms