Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPS6KB1P23443 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPS6KB1P23443 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPS6KB1P23443 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms