Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGA6P23229 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGA6P23229 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA6P23229 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ITGA6P23229 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms