Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTNP21246 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTNP21246 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTNP21246 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTNP21246 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTNP21246 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTNP21246 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTNP21246 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTNP21246 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTNP21246 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTNP21246 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTNP21246 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTNP21246 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTNP21246 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTNP21246 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTNP21246 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTNP21246 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTNP21246 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTNP21246 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTNP21246 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTNP21246 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTNP21246 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTNP21246 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTNP21246 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTNP21246 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTNP21246 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTNP21246 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTNP21246 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTNP21246 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTNP21246 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTNP21246 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTNP21246 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTNP21246 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTNP21246 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTNP21246 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTNP21246 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTNP21246 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTNP21246 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTNP21246 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTNP21246 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTNP21246 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTNP21246 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTNP21246 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTNP21246 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTNP21246 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTNP21246 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTNP21246 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTNP21246 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTNP21246 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTNP21246 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTNP21246 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTNP21246 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTNP21246 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTNP21246 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTNP21246 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTNP21246 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTNP21246 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTNP21246 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTNP21246 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTNP21246 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTNP21246 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTNP21246 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTNP21246 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTNP21246 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTNP21246 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTNP21246 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTNP21246 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTNP21246 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTNP21246 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTNP21246 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTNP21246 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTNP21246 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTNP21246 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTNP21246 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTNP21246 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTNP21246 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTNP21246 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTNP21246 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTNP21246 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTNP21246 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTNP21246 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTNP21246 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTNP21246 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTNP21246 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTNP21246 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTNP21246 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms