Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR2EP19388 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR2EP19388 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms