Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB42P16452 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB42P16452 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB42P16452 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB42P16452 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB42P16452 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB42P16452 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB42P16452 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB42P16452 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB42P16452 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB42P16452 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB42P16452 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB42P16452 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB42P16452 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB42P16452 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB42P16452 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB42P16452 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB42P16452 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB42P16452 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB42P16452 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB42P16452 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB42P16452 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB42P16452 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB42P16452 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB42P16452 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB42P16452 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB42P16452 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB42P16452 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB42P16452 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB42P16452 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB42P16452 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB42P16452 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB42P16452 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB42P16452 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPB42P16452 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EPB42P16452 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB42P16452 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB42P16452 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB42P16452 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB42P16452 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPB42P16452 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB42P16452 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB42P16452 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB42P16452 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB42P16452 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB42P16452 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB42P16452 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPB42P16452 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB42P16452 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB42P16452 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB42P16452 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB42P16452 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB42P16452 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB42P16452 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB42P16452 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB42P16452 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPB42P16452 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB42P16452 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB42P16452 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB42P16452 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB42P16452 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB42P16452 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB42P16452 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB42P16452 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPB42P16452 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB42P16452 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB42P16452 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB42P16452 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB42P16452 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB42P16452 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB42P16452 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPB42P16452 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB42P16452 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB42P16452 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB42P16452 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB42P16452 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPB42P16452 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPB42P16452 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB42P16452 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB42P16452 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB42P16452 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB42P16452 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB42P16452 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB42P16452 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB42P16452 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB42P16452 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB42P16452 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPB42P16452 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB42P16452 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB42P16452 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB42P16452 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB42P16452 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB42P16452 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB42P16452 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB42P16452 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EPB42P16452 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB42P16452 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB42P16452 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB42P16452 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPB42P16452 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms