Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPCAMP16422 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPCAMP16422 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPCAMP16422 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPCAMP16422 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms