Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA1P15976 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA1P15976 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA1P15976 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA1P15976 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA1P15976 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA1P15976 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA1P15976 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA1P15976 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA1P15976 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA1P15976 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA1P15976 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GATA1P15976 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GATA1P15976 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GATA1P15976 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA1P15976 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA1P15976 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA1P15976 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA1P15976 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA1P15976 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA1P15976 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA1P15976 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA1P15976 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA1P15976 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA1P15976 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA1P15976 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GATA1P15976 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA1P15976 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA1P15976 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA1P15976 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA1P15976 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA1P15976 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA1P15976 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA1P15976 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA1P15976 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GATA1P15976 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATA1P15976 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATA1P15976 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATA1P15976 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATA1P15976 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GATA1P15976 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATA1P15976 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATA1P15976 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATA1P15976 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATA1P15976 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GATA1P15976 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATA1P15976 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATA1P15976 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATA1P15976 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATA1P15976 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATA1P15976 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATA1P15976 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATA1P15976 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATA1P15976 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATA1P15976 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GATA1P15976 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATA1P15976 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATA1P15976 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GATA1P15976 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATA1P15976 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATA1P15976 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATA1P15976 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATA1P15976 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATA1P15976 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATA1P15976 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GATA1P15976 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GATA1P15976 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATA1P15976 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATA1P15976 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATA1P15976 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATA1P15976 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATA1P15976 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATA1P15976 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATA1P15976 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATA1P15976 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATA1P15976 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATA1P15976 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GATA1P15976 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GATA1P15976 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATA1P15976 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATA1P15976 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATA1P15976 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GATA1P15976 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATA1P15976 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATA1P15976 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATA1P15976 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GATA1P15976 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GATA1P15976 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATA1P15976 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATA1P15976 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GATA1P15976 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms