Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UCHL3P15374 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UCHL3P15374 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UCHL3P15374 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UCHL3P15374 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UCHL3P15374 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
UCHL3P15374 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UCHL3P15374 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms