Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOLR1P15328 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOLR1P15328 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOLR1P15328 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOLR1P15328 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOLR1P15328 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOLR1P15328 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOLR1P15328 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOLR1P15328 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOLR1P15328 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOLR1P15328 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms