Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRKCSHP14314 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRKCSHP14314 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKCSHP14314 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms