Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ETFAP13804 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ETFAP13804 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ETFAP13804 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ETFAP13804 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ETFAP13804 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ETFAP13804 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ETFAP13804 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ETFAP13804 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ETFAP13804 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ETFAP13804 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ETFAP13804 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ETFAP13804 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ETFAP13804 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ETFAP13804 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ETFAP13804 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ETFAP13804 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ETFAP13804 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ETFAP13804 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETFAP13804 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETFAP13804 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETFAP13804 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETFAP13804 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETFAP13804 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETFAP13804 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETFAP13804 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETFAP13804 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETFAP13804 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ETFAP13804 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ETFAP13804 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ETFAP13804 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ETFAP13804 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ETFAP13804 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ETFAP13804 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ETFAP13804 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ETFAP13804 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ETFAP13804 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ETFAP13804 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ETFAP13804 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ETFAP13804 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ETFAP13804 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFAP13804 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFAP13804 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFAP13804 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFAP13804 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFAP13804 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFAP13804 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFAP13804 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFAP13804 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFAP13804 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFAP13804 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFAP13804 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFAP13804 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFAP13804 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFAP13804 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFAP13804 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFAP13804 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFAP13804 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFAP13804 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFAP13804 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFAP13804 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFAP13804 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFAP13804 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFAP13804 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFAP13804 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFAP13804 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFAP13804 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFAP13804 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFAP13804 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFAP13804 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFAP13804 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFAP13804 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFAP13804 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFAP13804 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFAP13804 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFAP13804 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFAP13804 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETFAP13804 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETFAP13804 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETFAP13804 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETFAP13804 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETFAP13804 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFAP13804 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFAP13804 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFAP13804 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFAP13804 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFAP13804 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFAP13804 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFAP13804 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFAP13804 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFAP13804 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFAP13804 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFAP13804 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFAP13804 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFAP13804 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFAP13804 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETFAP13804 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETFAP13804 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETFAP13804 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ETFAP13804 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms