Protein–RNA interactions for Protein: P13385

TDGF1, Teratocarcinoma-derived growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGF1P13385 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TDGF1P13385 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDGF1P13385 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TDGF1P13385 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms