Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB1P12018 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB1P12018 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB1P12018 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB1P12018 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB1P12018 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VPREB1P12018 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VPREB1P12018 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VPREB1P12018 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VPREB1P12018 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VPREB1P12018 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB1P12018 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB1P12018 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB1P12018 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB1P12018 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB1P12018 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB1P12018 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB1P12018 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB1P12018 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB1P12018 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB1P12018 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB1P12018 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VPREB1P12018 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VPREB1P12018 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB1P12018 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB1P12018 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB1P12018 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB1P12018 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB1P12018 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB1P12018 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB1P12018 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VPREB1P12018 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB1P12018 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB1P12018 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VPREB1P12018 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB1P12018 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB1P12018 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VPREB1P12018 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB1P12018 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB1P12018 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB1P12018 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB1P12018 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB1P12018 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB1P12018 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VPREB1P12018 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
VPREB1P12018 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms