Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ODC1P11926 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ODC1P11926 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ODC1P11926 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ODC1P11926 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ODC1P11926 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ODC1P11926 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ODC1P11926 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ODC1P11926 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ODC1P11926 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODC1P11926 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODC1P11926 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODC1P11926 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODC1P11926 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODC1P11926 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODC1P11926 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODC1P11926 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ODC1P11926 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ODC1P11926 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ODC1P11926 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ODC1P11926 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ODC1P11926 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ODC1P11926 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODC1P11926 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODC1P11926 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODC1P11926 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODC1P11926 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODC1P11926 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODC1P11926 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODC1P11926 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODC1P11926 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODC1P11926 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODC1P11926 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODC1P11926 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ODC1P11926 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ODC1P11926 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ODC1P11926 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ODC1P11926 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ODC1P11926 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ODC1P11926 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ODC1P11926 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ODC1P11926 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ODC1P11926 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ODC1P11926 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ODC1P11926 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ODC1P11926 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ODC1P11926 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ODC1P11926 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ODC1P11926 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ODC1P11926 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ODC1P11926 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ODC1P11926 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ODC1P11926 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ODC1P11926 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ODC1P11926 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ODC1P11926 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ODC1P11926 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ODC1P11926 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ODC1P11926 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ODC1P11926 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ODC1P11926 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ODC1P11926 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ODC1P11926 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ODC1P11926 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ODC1P11926 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ODC1P11926 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ODC1P11926 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ODC1P11926 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ODC1P11926 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODC1P11926 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODC1P11926 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ODC1P11926 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODC1P11926 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODC1P11926 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODC1P11926 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODC1P11926 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ODC1P11926 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODC1P11926 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODC1P11926 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODC1P11926 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODC1P11926 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODC1P11926 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODC1P11926 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ODC1P11926 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ODC1P11926 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODC1P11926 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ODC1P11926 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms