Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TGFB3P10600 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TGFB3P10600 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TGFB3P10600 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms