Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T8

TMEM253, Transmembrane protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM253P0C7T8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM253P0C7T8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM253P0C7T8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM253P0C7T8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms