Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD48P09326 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD48P09326 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD48P09326 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD48P09326 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD48P09326 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CD48P09326 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD48P09326 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD48P09326 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD48P09326 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD48P09326 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD48P09326 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD48P09326 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD48P09326 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD48P09326 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD48P09326 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD48P09326 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD48P09326 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD48P09326 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD48P09326 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD48P09326 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD48P09326 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD48P09326 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD48P09326 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD48P09326 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD48P09326 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD48P09326 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD48P09326 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD48P09326 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD48P09326 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD48P09326 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD48P09326 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD48P09326 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD48P09326 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD48P09326 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD48P09326 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD48P09326 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CD48P09326 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD48P09326 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD48P09326 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD48P09326 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CD48P09326 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD48P09326 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD48P09326 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD48P09326 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD48P09326 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD48P09326 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD48P09326 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD48P09326 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD48P09326 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CD48P09326 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD48P09326 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD48P09326 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD48P09326 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD48P09326 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD48P09326 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD48P09326 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD48P09326 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD48P09326 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD48P09326 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD48P09326 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD48P09326 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD48P09326 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD48P09326 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CD48P09326 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD48P09326 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD48P09326 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD48P09326 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD48P09326 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD48P09326 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD48P09326 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD48P09326 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD48P09326 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD48P09326 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD48P09326 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD48P09326 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD48P09326 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD48P09326 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD48P09326 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD48P09326 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD48P09326 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CD48P09326 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD48P09326 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD48P09326 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD48P09326 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD48P09326 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD48P09326 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms