Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPTA1P02549 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPTA1P02549 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPTA1P02549 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms