Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRBV12-3P01733 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRBV12-3P01733 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV12-3P01733 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms