Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GASTP01350 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GASTP01350 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GASTP01350 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GASTP01350 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GASTP01350 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GASTP01350 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GASTP01350 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GASTP01350 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GASTP01350 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GASTP01350 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GASTP01350 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GASTP01350 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GASTP01350 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GASTP01350 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GASTP01350 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GASTP01350 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GASTP01350 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GASTP01350 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GASTP01350 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GASTP01350 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GASTP01350 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GASTP01350 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GASTP01350 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GASTP01350 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GASTP01350 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GASTP01350 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GASTP01350 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GASTP01350 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GASTP01350 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GASTP01350 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GASTP01350 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GASTP01350 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GASTP01350 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GASTP01350 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GASTP01350 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GASTP01350 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GASTP01350 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GASTP01350 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GASTP01350 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GASTP01350 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GASTP01350 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GASTP01350 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GASTP01350 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GASTP01350 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GASTP01350 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GASTP01350 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GASTP01350 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GASTP01350 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GASTP01350 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GASTP01350 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GASTP01350 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GASTP01350 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GASTP01350 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GASTP01350 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GASTP01350 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GASTP01350 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GASTP01350 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GASTP01350 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GASTP01350 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GASTP01350 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GASTP01350 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GASTP01350 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GASTP01350 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GASTP01350 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GASTP01350 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GASTP01350 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GASTP01350 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GASTP01350 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GASTP01350 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GASTP01350 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GASTP01350 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GASTP01350 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GASTP01350 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GASTP01350 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GASTP01350 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GASTP01350 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GASTP01350 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GASTP01350 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GASTP01350 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GASTP01350 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GASTP01350 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GASTP01350 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GASTP01350 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GASTP01350 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GASTP01350 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GASTP01350 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms