Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASS1P00966 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASS1P00966 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASS1P00966 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASS1P00966 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ASS1P00966 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASS1P00966 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASS1P00966 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASS1P00966 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASS1P00966 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASS1P00966 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASS1P00966 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASS1P00966 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASS1P00966 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASS1P00966 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASS1P00966 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASS1P00966 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASS1P00966 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASS1P00966 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASS1P00966 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASS1P00966 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASS1P00966 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASS1P00966 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASS1P00966 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASS1P00966 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASS1P00966 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASS1P00966 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ASS1P00966 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASS1P00966 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASS1P00966 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASS1P00966 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASS1P00966 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASS1P00966 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ASS1P00966 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASS1P00966 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASS1P00966 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASS1P00966 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASS1P00966 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASS1P00966 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASS1P00966 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASS1P00966 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASS1P00966 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ASS1P00966 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASS1P00966 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASS1P00966 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASS1P00966 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASS1P00966 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASS1P00966 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASS1P00966 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASS1P00966 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ASS1P00966 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASS1P00966 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASS1P00966 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASS1P00966 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASS1P00966 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASS1P00966 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASS1P00966 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ASS1P00966 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASS1P00966 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASS1P00966 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ASS1P00966 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASS1P00966 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASS1P00966 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ASS1P00966 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASS1P00966 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASS1P00966 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASS1P00966 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASS1P00966 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASS1P00966 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASS1P00966 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ASS1P00966 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ASS1P00966 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ASS1P00966 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASS1P00966 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ASS1P00966 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASS1P00966 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ASS1P00966 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ASS1P00966 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ASS1P00966 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASS1P00966 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASS1P00966 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASS1P00966 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ASS1P00966 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASS1P00966 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ASS1P00966 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASS1P00966 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASS1P00966 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ASS1P00966 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASS1P00966 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASS1P00966 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ASS1P00966 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASS1P00966 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASS1P00966 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASS1P00966 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ASS1P00966 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASS1P00966 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASS1P00966 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASS1P00966 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASS1P00966 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ASS1P00966 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms