Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1O95476 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CTDNEP1O95476 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTDNEP1O95476 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms