Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPBO95292 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPBO95292 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPBO95292 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPBO95292 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPBO95292 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPBO95292 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VAPBO95292 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPBO95292 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPBO95292 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPBO95292 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPBO95292 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPBO95292 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPBO95292 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPBO95292 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPBO95292 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VAPBO95292 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPBO95292 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPBO95292 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPBO95292 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPBO95292 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPBO95292 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPBO95292 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPBO95292 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPBO95292 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPBO95292 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPBO95292 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VAPBO95292 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAPBO95292 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAPBO95292 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAPBO95292 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VAPBO95292 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAPBO95292 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAPBO95292 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAPBO95292 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAPBO95292 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAPBO95292 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAPBO95292 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPBO95292 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPBO95292 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPBO95292 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPBO95292 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPBO95292 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPBO95292 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPBO95292 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPBO95292 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAPBO95292 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAPBO95292 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAPBO95292 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VAPBO95292 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAPBO95292 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAPBO95292 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAPBO95292 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VAPBO95292 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAPBO95292 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAPBO95292 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAPBO95292 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAPBO95292 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAPBO95292 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VAPBO95292 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAPBO95292 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAPBO95292 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAPBO95292 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAPBO95292 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAPBO95292 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPBO95292 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPBO95292 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPBO95292 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPBO95292 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPBO95292 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPBO95292 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPBO95292 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPBO95292 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPBO95292 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VAPBO95292 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAPBO95292 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAPBO95292 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VAPBO95292 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAPBO95292 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAPBO95292 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAPBO95292 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAPBO95292 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAPBO95292 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAPBO95292 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAPBO95292 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAPBO95292 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VAPBO95292 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPBO95292 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPBO95292 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPBO95292 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPBO95292 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPBO95292 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPBO95292 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPBO95292 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VAPBO95292 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAPBO95292 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAPBO95292 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAPBO95292 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAPBO95292 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VAPBO95292 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms